226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25270 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  100 
 
 		 697 aa  1379    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  47.94 
 
 		 634 aa  586  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  45.84 
 
 		 674 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.08 
 
 		 612 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.33 
 
 		 628 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.94 
 
 		 612 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  46.15 
 
 		 699 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.69 
 
 		 641 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.01 
 
 		 612 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.5 
 
 		 688 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  51.72 
 
 		 672 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.64 
 
 		 639 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  40.59 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.55 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  43.21 
 
 		 584 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  40.22 
 
 		 503 aa  291  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  38.69 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  40.7 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  33.88 
 
 		 498 aa  232  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  35.8 
 
 		 487 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  32.57 
 
 		 472 aa  151  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  30.07 
 
 		 470 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  39.19 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.79 
 
 		 596 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  42.03 
 
 		 186 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  39.29 
 
 		 197 aa  118  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  39.58 
 
 		 193 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40 
 
 		 435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  42.02 
 
 		 193 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  42.02 
 
 		 193 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  38.81 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  40.74 
 
 		 469 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  38.19 
 
 		 193 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  38.06 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.04 
 
 		 589 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.26 
 
 		 609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  42.02 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 		 581 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.57 
 
 		 589 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  40.97 
 
 		 381 aa  111  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.83 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  34.88 
 
 		 592 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.46 
 
 		 626 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  38.81 
 
 		 188 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  35.58 
 
 		 591 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  38.3 
 
 		 622 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  36.57 
 
 		 589 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 		 570 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.85 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  35.19 
 
 		 695 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  38.3 
 
 		 187 aa  107  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.31 
 
 		 404 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.41 
 
 		 623 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.41 
 
 		 622 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  36.57 
 
 		 604 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.41 
 
 		 625 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.06 
 
 		 403 aa  105  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  31.72 
 
 		 659 aa  104  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.56 
 
 		 576 aa  103  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  36.88 
 
 		 691 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.23 
 
 		 619 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.23 
 
 		 619 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.23 
 
 		 619 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.58 
 
 		 598 aa  99.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  34.33 
 
 		 184 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.83 
 
 		 200 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  34.33 
 
 		 178 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 		 178 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  32.84 
 
 		 178 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  32.91 
 
 		 249 aa  91.3  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.04 
 
 		 439 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1030 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  25.68 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  30.22 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 		 719 aa  64.3  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  33.61 
 
 		 165 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30.07 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.23 
 
 		 1130 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.11 
 
 		 693 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1051 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.68 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.38 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1351 aa  60.8  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.12 
 
 		 2296 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1026 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1750 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.36 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  30.14 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  34.62 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  35.17 
 
 		 190 aa  59.3  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.86 
 
 		 1292 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  35.04 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  31.12 
 
 		 623 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.16 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  25.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  26.85 
 
 		 174 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  32.06 
 
 		 165 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  32.06 
 
 		 172 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.21 
 
 		 173 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>