More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23600 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  100 
 
 		 434 aa  871    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  62.79 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  63.7 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  65.23 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  63.22 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  60.82 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  60.59 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  62.65 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  59.36 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  56.59 
 
 		 438 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  58.58 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  56.42 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  58.22 
 
 		 448 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59 
 
 		 435 aa  494  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  56.14 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  56.98 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  56.98 
 
 		 441 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  54.91 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  56.69 
 
 		 436 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  56.36 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  55.63 
 
 		 432 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  54.24 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  54.2 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 		 435 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  54.52 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  54.52 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  55.94 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  57.01 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  54.32 
 
 		 439 aa  481  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  54.52 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  54.3 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  55.13 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  53.71 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  55.15 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  54.02 
 
 		 449 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  53.71 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  51.83 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.91 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.87 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  47.93 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.91 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.53 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  47.37 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.65 
 
 		 429 aa  362  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  44.87 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  44.6 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  44.95 
 
 		 443 aa  354  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  45.29 
 
 		 443 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.96 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  42.23 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  43.89 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  44.83 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.16 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.39 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.28 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  44.55 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.6 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  45.06 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  43.45 
 
 		 423 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 429 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.03 
 
 		 442 aa  342  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  44.93 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  42.6 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  43.85 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  43.72 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  43.85 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  43.78 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  44.06 
 
 		 444 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  44.32 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  44.32 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.65 
 
 		 448 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  44.57 
 
 		 445 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  41.94 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.19 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  41.29 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  43.64 
 
 		 447 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  43.78 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  41.32 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>