More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 303 aa  594  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  49.5 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  48.68 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  48.66 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  48.49 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  46.15 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  46.15 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  46.15 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  46.77 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  43.42 
 
 		 334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  46.62 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  44.95 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  46.82 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  44.26 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  42.81 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  45.36 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  39.94 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  45.1 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  41.41 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  41.72 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  42.47 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  39.81 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  42 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.83 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  38.91 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  42.3 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  37.5 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  41.58 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  38.93 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  36.66 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  36.01 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  37.46 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  35.58 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  36.42 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  38.14 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  39.24 
 
 		 313 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  34.08 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  38.26 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.96 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.66 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  37.7 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.48 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.37 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.39 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  33.23 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  36.28 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.44 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 319 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  33.12 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.84 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  34.09 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.02 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.01 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.59 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  36.89 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  42.92 
 
 		 251 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  31.85 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.78 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  33.66 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.96 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  33.86 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  32.91 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  33.65 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  32.01 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.57 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.46 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  30.94 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.95 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.41 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.09 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.18 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.46 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  37.87 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  37.87 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  28.74 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.95 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  33.98 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  33.98 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  33.98 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.86 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  33.98 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  33.98 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  33.98 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>