225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 
227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 
218 aa  214  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  48.43 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  49.78 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  49.33 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  47.71 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  47.37 
 
 
215 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.56 
 
 
219 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.07 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  37.78 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  42.79 
 
 
220 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
218 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  37.33 
 
 
218 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.89 
 
 
222 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
227 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  42.17 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  38.12 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
223 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  40.89 
 
 
216 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
212 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 
215 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 
220 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 
231 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
222 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
212 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 
230 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.92 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  30.4 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  31.74 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  31.74 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.82 
 
 
212 aa  89  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  34.96 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
211 aa  85.1  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.76 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.02 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.07 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  30.33 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  32.22 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.89 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.68 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.67 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  24.89 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.39 
 
 
320 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  35.76 
 
 
374 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  26.64 
 
 
323 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  26.64 
 
 
323 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.43 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
309 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.48 
 
 
339 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  30.09 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  30.92 
 
 
294 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.07 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  25.94 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  29.07 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  29.07 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  33.58 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.11 
 
 
320 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
194 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
309 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28 
 
 
328 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
295 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
306 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  29.22 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  28.91 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.52 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  29.58 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  26.17 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.57 
 
 
297 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.11 
 
 
327 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  28.71 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
296 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
298 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>