More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  100 
 
 
318 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  48.25 
 
 
328 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  51.45 
 
 
318 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  48.57 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  50.97 
 
 
323 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  50 
 
 
344 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  46.54 
 
 
321 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  49.84 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  49.84 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  49.84 
 
 
325 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  44.51 
 
 
330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 
332 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 
313 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  40.88 
 
 
315 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  39.57 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  40.68 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  42.37 
 
 
308 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  39.18 
 
 
328 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  35.42 
 
 
336 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  40.69 
 
 
316 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  41.42 
 
 
319 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  38.17 
 
 
333 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  36.91 
 
 
318 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  35.96 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.51 
 
 
310 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  37.23 
 
 
318 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  39.21 
 
 
327 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  31.83 
 
 
310 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  32.93 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  35.97 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  35.24 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.45 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  32.93 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  37.73 
 
 
315 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.97 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.03 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.87 
 
 
311 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  34.38 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  27.51 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.51 
 
 
326 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  35.31 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.13 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  36.25 
 
 
317 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
308 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  28.88 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.37 
 
 
315 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 
303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  30.56 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  29.65 
 
 
310 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  34.67 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  29.21 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.23 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.59 
 
 
303 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  32.5 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  33.44 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  35.18 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  35.18 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  35.18 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 
328 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 
328 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 
303 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  34.11 
 
 
314 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.79 
 
 
320 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
310 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 
322 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  33.95 
 
 
310 aa  105  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 
320 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  29.65 
 
 
325 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  32.71 
 
 
312 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  32.92 
 
 
312 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 
314 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 
303 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 
332 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 
317 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 
306 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30.49 
 
 
323 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 
332 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  35.37 
 
 
318 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  34.49 
 
 
318 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  27.94 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  34.49 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  34.94 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  33.99 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 
312 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
312 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 
312 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 
312 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  35.28 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 
312 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 
312 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>