More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  67.04 
 
 		 651 aa  759    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  62.06 
 
 		 662 aa  723    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  100 
 
 		 639 aa  1263    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  48.74 
 
 		 663 aa  592  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  49.42 
 
 		 678 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  45.38 
 
 		 664 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  45.84 
 
 		 671 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  47.85 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  47.95 
 
 		 573 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  47.23 
 
 		 582 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  47.41 
 
 		 582 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  47.73 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  47.41 
 
 		 582 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  44.72 
 
 		 611 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  47.75 
 
 		 610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  43.8 
 
 		 629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  43.59 
 
 		 582 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  42.43 
 
 		 581 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  42.61 
 
 		 582 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  42.31 
 
 		 581 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  45.41 
 
 		 694 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  40.03 
 
 		 580 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  40.58 
 
 		 585 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  43.58 
 
 		 592 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  40.04 
 
 		 602 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  42.41 
 
 		 602 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  41.13 
 
 		 531 aa  379  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  41.54 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  44.71 
 
 		 574 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  44.09 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  42.12 
 
 		 586 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0292  BCCT transporter  43.12 
 
 		 513 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  37.44 
 
 		 637 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  38.1 
 
 		 573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  37.96 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  38.61 
 
 		 606 aa  333  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  38.01 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  35.3 
 
 		 600 aa  332  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  37.9 
 
 		 516 aa  331  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  37.9 
 
 		 516 aa  331  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  38.1 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  38.1 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  38.1 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  36.99 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  37.33 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  36.85 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  37.55 
 
 		 516 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  38.83 
 
 		 490 aa  326  9e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  36.96 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  37.43 
 
 		 580 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  35.55 
 
 		 503 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  36.99 
 
 		 567 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  38.6 
 
 		 558 aa  317  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  33.28 
 
 		 642 aa  316  7e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  36.03 
 
 		 505 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  36.03 
 
 		 505 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  36.03 
 
 		 505 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  36.03 
 
 		 505 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  36.03 
 
 		 505 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  36.03 
 
 		 505 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  35.16 
 
 		 551 aa  312  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  36.15 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  36.42 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 520 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 520 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  36.42 
 
 		 504 aa  309  8e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  36.46 
 
 		 550 aa  306  7e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  34.49 
 
 		 546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  36.19 
 
 		 505 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  36.03 
 
 		 681 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  37.31 
 
 		 611 aa  303  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  35.95 
 
 		 498 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  35.23 
 
 		 504 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  35.73 
 
 		 523 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.23 
 
 		 637 aa  300  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  33.77 
 
 		 548 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  33.77 
 
 		 548 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  33.82 
 
 		 530 aa  297  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  33.51 
 
 		 603 aa  297  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  36.5 
 
 		 534 aa  296  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  33.9 
 
 		 494 aa  296  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31680  choline/carnitine/betaine transport  35.8 
 
 		 534 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  35.94 
 
 		 671 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  37.4 
 
 		 681 aa  293  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  33.76 
 
 		 542 aa  293  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  32.63 
 
 		 665 aa  293  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01900  choline/carnitine/betaine transport  36.29 
 
 		 619 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  35.01 
 
 		 653 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.18 
 
 		 657 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 667 aa  290  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  34.84 
 
 		 508 aa  289  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  38.92 
 
 		 533 aa  289  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  34.12 
 
 		 666 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  33.49 
 
 		 661 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23270  choline/carnitine/betaine transport  34.4 
 
 		 695 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0746939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  36.27 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2792  choline/carnitine/betaine transporter  30.62 
 
 		 711 aa  288  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  33.21 
 
 		 606 aa  287  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  35.16 
 
 		 682 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  33.76 
 
 		 684 aa  286  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>