More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22070 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  100 
 
 
269 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  39.93 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  42.8 
 
 
261 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  42.01 
 
 
260 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  42.01 
 
 
260 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  42.42 
 
 
255 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  40.94 
 
 
256 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  43.4 
 
 
261 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  41.64 
 
 
260 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  41.26 
 
 
259 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  40.98 
 
 
248 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  42.32 
 
 
260 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  40.6 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  38.61 
 
 
249 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  36.06 
 
 
252 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  34.72 
 
 
271 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  38.96 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  40.15 
 
 
253 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  41.87 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  34.6 
 
 
276 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  42.31 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  36.96 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  37.78 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  36.98 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  37.35 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  40.15 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  30.08 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  35.06 
 
 
239 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  34.26 
 
 
247 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
247 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  28.63 
 
 
253 aa  109  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  32.92 
 
 
252 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  36.58 
 
 
251 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  31.58 
 
 
264 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  27.8 
 
 
261 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  36.25 
 
 
250 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  27.65 
 
 
262 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  34.66 
 
 
253 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  29.44 
 
 
251 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  33.47 
 
 
248 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  29.92 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  29.34 
 
 
256 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  34.44 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  30.83 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  31.19 
 
 
306 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  35.11 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  33.59 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  35.02 
 
 
255 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  31.75 
 
 
251 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  32.93 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  31.03 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  32.52 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  30.92 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  30.27 
 
 
252 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  30.27 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  29.89 
 
 
252 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  32.11 
 
 
251 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  32.57 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  33.08 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  31.3 
 
 
251 aa  89  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  32.44 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  29.18 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  27.52 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  31.43 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  30.89 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  29.12 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  28.9 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  37.6 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  33.9 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  34.51 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  33.48 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  30.62 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  24.54 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  31.37 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  30.62 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  22.93 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  27.1 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  27.1 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  27.1 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  27.1 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  27.1 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  30.08 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  29.34 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  26.05 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  24.8 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  26.25 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  24.81 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25.57 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  72  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  24.44 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  24.52 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  24.15 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  23.08 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  26.34 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>