More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  74.7 
 
 		 430 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  75.83 
 
 		 428 aa  648    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  77.59 
 
 		 427 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 422 aa  858    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  74.94 
 
 		 429 aa  650    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  72.04 
 
 		 432 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  72.92 
 
 		 423 aa  618  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  71.5 
 
 		 426 aa  612  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  70.21 
 
 		 435 aa  611  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  72.12 
 
 		 420 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  71.5 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  72.46 
 
 		 426 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  72.73 
 
 		 432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  73.08 
 
 		 423 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  74.23 
 
 		 440 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  74.4 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 		 422 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  69.95 
 
 		 445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  69.06 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  70.34 
 
 		 447 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  67.22 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  67.13 
 
 		 453 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  67.38 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  67.61 
 
 		 442 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  69.5 
 
 		 452 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 421 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 411 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 412 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  60.36 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 416 aa  471  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 415 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  55.4 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 413 aa  461  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.05 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 414 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  55.48 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  55.71 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.79 
 
 		 410 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 417 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 417 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 413 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  55.92 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  55.82 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  53.03 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  57.47 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  55.95 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  55.06 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  54.16 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>