More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19530 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  98.67 
 
 
77 bp  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  96 
 
 
77 bp  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  96 
 
 
77 bp  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  96 
 
 
77 bp  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  96 
 
 
77 bp  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  96 
 
 
77 bp  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.22634e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.59989e-13  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0013  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0057  tRNA-Met  95.77 
 
 
77 bp  117  4e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0046  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0668853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  2.13655e-06 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0018  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0047  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  4e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.0659545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0025  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0026  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0054  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0040  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0054  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27400  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0222843  normal  0.668834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0055  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  94.37 
 
 
77 bp  109  9e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0048  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0050  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0359841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0049  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0051  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0072  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0071  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27450  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.38456e-09  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0117  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214909  hitchhiker  3.6975e-06 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0054  tRNA-Met  93.06 
 
 
74 bp  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00220789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.50428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  3.39625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.57655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.66193e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.66673e-06  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.30751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.36537e-05  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0021  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.790963 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  93.06 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.36234e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  93.06 
 
 
74 bp  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  93.06 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  93.06 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.36234e-08  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  93.06 
 
 
74 bp  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  93.06 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.3753e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0067  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  93.06 
 
 
74 bp  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  93.06 
 
 
74 bp  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0051  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59293e-09 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0052  tRNA-Met  93.06 
 
 
74 bp  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.23304e-10 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0051  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.704377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>