More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.96 
 
 
689 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51.21 
 
 
724 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.67 
 
 
979 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.84 
 
 
691 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.58 
 
 
741 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.97 
 
 
713 aa  781    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.11 
 
 
754 aa  675    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.05 
 
 
723 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.74 
 
 
704 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.05 
 
 
734 aa  774    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  58.2 
 
 
745 aa  793    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.97 
 
 
691 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.82 
 
 
712 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.97 
 
 
691 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51.25 
 
 
766 aa  636    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.96 
 
 
706 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
762 aa  1489    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.68 
 
 
729 aa  794    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.63 
 
 
718 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.53 
 
 
691 aa  631  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  51.75 
 
 
691 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.19 
 
 
749 aa  626  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51.15 
 
 
756 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.59 
 
 
712 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.32 
 
 
708 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.68 
 
 
788 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.68 
 
 
733 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.33 
 
 
714 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.2 
 
 
708 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.57 
 
 
706 aa  515  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.53 
 
 
706 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.13 
 
 
693 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.39 
 
 
697 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.3 
 
 
679 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.63 
 
 
756 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 
693 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.73 
 
 
698 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.52 
 
 
698 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.34 
 
 
691 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.55 
 
 
699 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.21 
 
 
698 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.75 
 
 
691 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.72 
 
 
695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
698 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
697 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.54 
 
 
448 aa  253  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.5 
 
 
543 aa  224  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 
543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 
543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.96 
 
 
602 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.1 
 
 
1376 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.32 
 
 
634 aa  210  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  42.07 
 
 
637 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.1 
 
 
637 aa  208  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.78 
 
 
636 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.04 
 
 
646 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  34.78 
 
 
597 aa  201  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.38 
 
 
562 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.32 
 
 
630 aa  201  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.47 
 
 
607 aa  201  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.52 
 
 
624 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 
545 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
615 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.36 
 
 
606 aa  197  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.65 
 
 
615 aa  197  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.67 
 
 
588 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.45 
 
 
615 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.8 
 
 
708 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.32 
 
 
779 aa  194  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
615 aa  194  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.74 
 
 
709 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 
709 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.3 
 
 
616 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 
644 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
615 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
615 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
615 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.52 
 
 
588 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.32 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.32 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 
763 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.51 
 
 
546 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.33 
 
 
731 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  37.53 
 
 
615 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.28 
 
 
601 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 
615 aa  191  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.03 
 
 
647 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  36.71 
 
 
493 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.03 
 
 
658 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 
615 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.98 
 
 
881 aa  190  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 
615 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 
615 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 
615 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.35 
 
 
716 aa  190  9e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.47 
 
 
598 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.09 
 
 
563 aa  190  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.72 
 
 
625 aa  190  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.84 
 
 
600 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.77 
 
 
619 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>