119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1045    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  53.08 
 
 
502 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  45.83 
 
 
523 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  43.16 
 
 
577 aa  334  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  42.22 
 
 
561 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  51.2 
 
 
360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  36.4 
 
 
556 aa  113  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  47.26 
 
 
602 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  30.86 
 
 
580 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  43.7 
 
 
566 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  44.14 
 
 
584 aa  99  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  34.01 
 
 
535 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  42.66 
 
 
714 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  44.09 
 
 
580 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  38.89 
 
 
605 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  44.09 
 
 
499 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  43.31 
 
 
558 aa  97.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  42.96 
 
 
568 aa  96.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  40.58 
 
 
620 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  40.65 
 
 
508 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  40.74 
 
 
585 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  39.33 
 
 
553 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  43.17 
 
 
603 aa  94  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  44.14 
 
 
748 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  43.65 
 
 
530 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  43.2 
 
 
507 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  37.84 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  30.96 
 
 
567 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40.48 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  42.98 
 
 
222 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  42.86 
 
 
551 aa  80.9  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  40.34 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  30.96 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  47.73 
 
 
579 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  37.5 
 
 
519 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  42.19 
 
 
637 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  40.16 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  40.16 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  39.47 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  29.7 
 
 
516 aa  67.4  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  32.73 
 
 
443 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  32.29 
 
 
443 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  40.3 
 
 
618 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  42.35 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  42.35 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  40.83 
 
 
480 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  24.55 
 
 
405 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  35.04 
 
 
310 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  43.06 
 
 
635 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  39.53 
 
 
743 aa  57.4  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  32.9 
 
 
436 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  32.26 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  32.26 
 
 
433 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  24.48 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  33.33 
 
 
441 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  32.26 
 
 
433 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  32.9 
 
 
440 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  31.54 
 
 
550 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  34.62 
 
 
198 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  32.26 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  32.26 
 
 
428 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  44.29 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  34 
 
 
169 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  33.04 
 
 
535 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  41.18 
 
 
620 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  41.79 
 
 
593 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  41.79 
 
 
578 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  31.61 
 
 
433 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  41.79 
 
 
593 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  41.79 
 
 
578 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  41.79 
 
 
578 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  41.79 
 
 
581 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  41.79 
 
 
581 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  41.79 
 
 
578 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  39.13 
 
 
572 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  40.58 
 
 
434 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  41.1 
 
 
535 aa  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  36.22 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  40.58 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  25.98 
 
 
426 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  40.3 
 
 
506 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  38.04 
 
 
557 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  31.33 
 
 
464 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  39.53 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  36.36 
 
 
709 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  38.04 
 
 
602 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  41.79 
 
 
519 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  42.86 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  41.79 
 
 
524 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  23.54 
 
 
404 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  37.93 
 
 
565 aa  47  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  39.13 
 
 
117 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  24.43 
 
 
512 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  23.71 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  31.82 
 
 
511 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  31.06 
 
 
488 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  29.83 
 
 
469 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  34.18 
 
 
586 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  35.82 
 
 
539 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  40.3 
 
 
582 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>