More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  61.73 
 
 		 987 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  69.69 
 
 		 974 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  67.44 
 
 		 1024 aa  680    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  69.46 
 
 		 1334 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  73.18 
 
 		 990 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  72.65 
 
 		 1041 aa  709    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  75.6 
 
 		 1265 aa  785    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  73.28 
 
 		 908 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 952 aa  1890    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  70.11 
 
 		 1427 aa  742    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  66.34 
 
 		 1040 aa  686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  74.27 
 
 		 1007 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  69.61 
 
 		 1151 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  67.37 
 
 		 1058 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  72.71 
 
 		 1091 aa  712    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  76.52 
 
 		 1048 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  77.14 
 
 		 944 aa  740    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  74.58 
 
 		 1244 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  65.1 
 
 		 1093 aa  718    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  65.58 
 
 		 1080 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  73.42 
 
 		 959 aa  665    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  65.28 
 
 		 1016 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  76.5 
 
 		 1018 aa  733    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  61.73 
 
 		 991 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  76.58 
 
 		 1043 aa  762    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  65.45 
 
 		 717 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  74.48 
 
 		 1113 aa  728    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  78.19 
 
 		 1117 aa  752    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  76.52 
 
 		 922 aa  715    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  72.37 
 
 		 702 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  72.56 
 
 		 1070 aa  685    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  61.73 
 
 		 991 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  60.3 
 
 		 961 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  63.47 
 
 		 1022 aa  626  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  62.39 
 
 		 953 aa  628  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  64.27 
 
 		 1093 aa  616  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  45.61 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  44.07 
 
 		 559 aa  330  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  44.22 
 
 		 636 aa  319  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  43.7 
 
 		 564 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  40.81 
 
 		 494 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  42.45 
 
 		 411 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  42.29 
 
 		 562 aa  306  8.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  44.25 
 
 		 571 aa  303  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  37.8 
 
 		 1175 aa  301  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.04 
 
 		 1056 aa  300  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39.95 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.44 
 
 		 543 aa  294  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  37.53 
 
 		 476 aa  291  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.15 
 
 		 496 aa  290  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.15 
 
 		 496 aa  290  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  37.95 
 
 		 1012 aa  290  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.55 
 
 		 503 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  38.65 
 
 		 483 aa  287  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  37.8 
 
 		 1057 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  37.86 
 
 		 938 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  35.97 
 
 		 1128 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.57 
 
 		 497 aa  285  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  37.05 
 
 		 1132 aa  284  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.88 
 
 		 1128 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  42.17 
 
 		 485 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  42.41 
 
 		 485 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  39.43 
 
 		 1071 aa  283  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  40.57 
 
 		 497 aa  283  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  37.8 
 
 		 1073 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  36.64 
 
 		 1120 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.62 
 
 		 492 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  36.84 
 
 		 1073 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  36.8 
 
 		 1132 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  35.73 
 
 		 1142 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  39.68 
 
 		 531 aa  281  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  39.23 
 
 		 491 aa  281  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  36.52 
 
 		 1082 aa  280  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  36.2 
 
 		 866 aa  280  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2643  ribonuclease, Rne/Rng family  37.35 
 
 		 1029 aa  279  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  35.49 
 
 		 1102 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3290  ribonuclease E  37.35 
 
 		 1025 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  35.21 
 
 		 926 aa  279  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2475  RNAse E  38.79 
 
 		 1095 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.350754  normal  0.0309861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  38.61 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.52 
 
 		 1124 aa  278  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.18 
 
 		 497 aa  278  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  36.23 
 
 		 928 aa  278  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.28 
 
 		 496 aa  278  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2405  RNAse E  38.52 
 
 		 1093 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  36.97 
 
 		 1074 aa  278  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2634  ribonuclease  37.99 
 
 		 1201 aa  278  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0740113  hitchhiker  0.00367459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  37.08 
 
 		 1086 aa  278  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2567  RNAse E  38.52 
 
 		 1098 aa  277  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02342  RNase E  38.26 
 
 		 1131 aa  277  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.596666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  40.68 
 
 		 942 aa  277  7e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  37.08 
 
 		 1091 aa  277  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  36.99 
 
 		 1139 aa  276  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  35.89 
 
 		 1141 aa  277  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  37.75 
 
 		 483 aa  276  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  36.93 
 
 		 515 aa  276  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  37.08 
 
 		 1090 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0479  ribonuclease  35.39 
 
 		 1368 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  37.47 
 
 		 968 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  36.84 
 
 		 1072 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>