31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1251    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  32.29 
 
 
675 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  32.15 
 
 
651 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  34.94 
 
 
619 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  25.87 
 
 
633 aa  203  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  29.65 
 
 
654 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  31.34 
 
 
603 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  31.33 
 
 
659 aa  194  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  30.55 
 
 
618 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  31.43 
 
 
673 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  32.19 
 
 
638 aa  176  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  32.35 
 
 
584 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  30.51 
 
 
867 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  30.64 
 
 
692 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  30.64 
 
 
651 aa  161  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  36.13 
 
 
770 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  25.54 
 
 
616 aa  138  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
623 aa  136  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  25.35 
 
 
624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  37.19 
 
 
593 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  23.79 
 
 
593 aa  85.9  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.27 
 
 
615 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  24.2 
 
 
580 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  26.24 
 
 
624 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  22.53 
 
 
742 aa  65.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  25.81 
 
 
551 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  30.11 
 
 
467 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  30.11 
 
 
467 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  30.64 
 
 
473 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  29.84 
 
 
471 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  27.27 
 
 
483 aa  45.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>