More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17190 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  54.36 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  46.52 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  41.13 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  32.68 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.87 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  30.62 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  36.19 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 347 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 314 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  29.52 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  30.15 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2954  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000398128  unclonable  0.0000000375451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2375  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  30.04 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.67 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4369  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1675  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  26.71 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>