More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16760 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  79.01 
 
 		 82 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 81 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  75.31 
 
 		 82 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 81 aa  123  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  75.31 
 
 		 82 aa  121  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  78.21 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  71.6 
 
 		 82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  77.78 
 
 		 81 aa  117  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  68.29 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  68.75 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  65.43 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  58.54 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  60.49 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  60.49 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  65.33 
 
 		 79 aa  93.6  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  53.85 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 82 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  52.56 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  54.55 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 79 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  50 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  51.32 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  54.24 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  50.75 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  45.57 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  46.25 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  41.77 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  44.3 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  44.3 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  40 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  45.95 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  38.96 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  48.57 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  36.71 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  45.59 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  38.16 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  38.16 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>