62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  67.86 
 
 		 114 aa  160  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  74.55 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  60.71 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  67.86 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  59.29 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  55.26 
 
 		 214 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  54.39 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  66.07 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  59.26 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  57.94 
 
 		 114 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  65.56 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  55.86 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  52.1 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  60 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  53.7 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  50.91 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  57.29 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  48.67 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  49.54 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  48.67 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  52.78 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  53.64 
 
 		 114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  49.54 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  53.85 
 
 		 114 aa  97.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  52.75 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  50.46 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  51.11 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  51.11 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  51.11 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  51.11 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  51.11 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  51.11 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  40.19 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  45.24 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  41.12 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  39.39 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  37.96 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  40.95 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  36.45 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  37.37 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  39.45 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  43.53 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  38.32 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  37.04 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  33.65 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  32.69 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  41.86 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  32.11 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  39.78 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  37.61 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  34.12 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  32.46 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  36.67 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2167  electron transport protein  41.67 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>