More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  100 
 
 
397 aa  805    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  65.35 
 
 
404 aa  539  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  65.49 
 
 
404 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  65.83 
 
 
401 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  62.98 
 
 
431 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  65.24 
 
 
398 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  64.25 
 
 
404 aa  521  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  65.2 
 
 
409 aa  491  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  61.48 
 
 
392 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  61.48 
 
 
396 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  64.78 
 
 
409 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  64.9 
 
 
396 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  64.23 
 
 
397 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  57.69 
 
 
416 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  56.17 
 
 
398 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  54.04 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  54.36 
 
 
382 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  54.36 
 
 
382 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  55.98 
 
 
395 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  54.34 
 
 
382 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  53.85 
 
 
382 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  53.65 
 
 
387 aa  401  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  54.96 
 
 
384 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  54.43 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  52.67 
 
 
386 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  53.39 
 
 
386 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  52.59 
 
 
395 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  50.71 
 
 
411 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  46.12 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  46.65 
 
 
404 aa  355  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  44.31 
 
 
404 aa  352  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  41.48 
 
 
388 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
390 aa  127  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
419 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.6 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
440 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
391 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.18 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
419 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
464 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
396 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
415 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
355 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.21 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
396 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.69 
 
 
428 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
396 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 
442 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  28.84 
 
 
480 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
446 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
373 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
405 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.1 
 
 
650 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
413 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
355 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
410 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
422 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.12 
 
 
427 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.44 
 
 
423 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
414 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.03 
 
 
431 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
378 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
379 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
435 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.36 
 
 
420 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
405 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.15 
 
 
443 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.97 
 
 
443 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
430 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.15 
 
 
499 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.15 
 
 
443 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  30.84 
 
 
443 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.97 
 
 
443 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
498 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.15 
 
 
495 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
424 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
355 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
423 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
414 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 
387 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>