14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15100    100 
 
 		 1065 bp  2111    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  85.02 
 
 		 1077 bp  149  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  85.22 
 
 		 1077 bp  149  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  85.02 
 
 		 1077 bp  149  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  85.15 
 
 		 1077 bp  147  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  85.15 
 
 		 1077 bp  147  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    84.56 
 
 		 3818 bp  103  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  80.82 
 
 		 957 bp  101  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  93.18 
 
 		 990 bp  63.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  92.68 
 
 		 1446 bp  58  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20950    89.36 
 
 		 351 bp  54  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 999 bp  54  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 999 bp  54  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  88.64 
 
 		 987 bp  48.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>