More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  45.4 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  48.72 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  41.04 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2326  Shikimate kinase  48.21 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0927033  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  42.2 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  40.12 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  41.86 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  45 
 
 		 172 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  41.57 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2010  Shikimate kinase  45.39 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269674 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  43.67 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  40 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  40 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  40 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  44.12 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  44.12 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  42.24 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3152  Shikimate kinase  44.94 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  43.31 
 
 		 519 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1834  Shikimate kinase  40.57 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252132  normal  0.208051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  42.42 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  39.5 
 
 		 577 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  41.14 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  43.67 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  44.67 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  40.94 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  46.67 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  42.77 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  40.49 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  41.72 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12670  shikimate kinase  45.06 
 
 		 235 aa  111  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.799504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  42.07 
 
 		 167 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  36.59 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  39.51 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  39.75 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  42.51 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  47.3 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  45.62 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  42.33 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  39.88 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  41.29 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 		 560 aa  107  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  41.24 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  40.12 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  39.88 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  43.75 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  41.28 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  40.36 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  41.28 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  38.55 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  41.28 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  40.14 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 579 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  41.67 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  41.1 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4297  Shikimate kinase  39.16 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.911234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1700  shikimate kinase  40.85 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  40.66 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  40.49 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  39.11 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  37.66 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  36.31 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  37.06 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  40.94 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  38.89 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  37.66 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  40.36 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  35.76 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  40.12 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2486  shikimate kinase  45.14 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0460027  normal  0.0259491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  35.76 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  38.6 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  41.72 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  39.24 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  36.36 
 
 		 181 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  41.82 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  37.11 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 604 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  39.39 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  44.53 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  38.32 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 579 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  35 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  39.52 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  40.99 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  44.2 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  37.91 
 
 		 277 aa  99  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.52 
 
 		 593 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  40.12 
 
 		 169 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  33.33 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  40.12 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  42.45 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  41.98 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  34.5 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  38.65 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  35.09 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  40 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  42.34 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>