More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  76.47 
 
 		 493 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  78.99 
 
 		 485 aa  773    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  77.26 
 
 		 495 aa  737    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  74.55 
 
 		 485 aa  730    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  78.6 
 
 		 480 aa  748    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  73.27 
 
 		 481 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  76.69 
 
 		 485 aa  729    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  74.45 
 
 		 499 aa  716    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  78.11 
 
 		 492 aa  763    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 493 aa  989    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  77.66 
 
 		 500 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  70.45 
 
 		 500 aa  667    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  73.46 
 
 		 492 aa  710    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  82.65 
 
 		 496 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  82.99 
 
 		 492 aa  808    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  83.06 
 
 		 490 aa  806    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  76.89 
 
 		 493 aa  705    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  83.44 
 
 		 488 aa  774    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  75.46 
 
 		 487 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  81.97 
 
 		 488 aa  794    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  75.9 
 
 		 495 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  74.85 
 
 		 507 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  77.14 
 
 		 487 aa  742    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  74.44 
 
 		 481 aa  716    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  74.64 
 
 		 479 aa  722    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  79.75 
 
 		 491 aa  770    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  79.27 
 
 		 505 aa  714    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  78.53 
 
 		 496 aa  724    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  76.89 
 
 		 493 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  79.55 
 
 		 491 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  78.02 
 
 		 493 aa  771    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  71.89 
 
 		 491 aa  709    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  76.81 
 
 		 515 aa  732    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  76.78 
 
 		 488 aa  715    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  74.64 
 
 		 479 aa  722    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  75.25 
 
 		 490 aa  731    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  74.64 
 
 		 479 aa  722    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  73.62 
 
 		 481 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  65.38 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  64.38 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  62.54 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  59.1 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  63.06 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  56.02 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  58.43 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.61 
 
 		 736 aa  338  9e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.69 
 
 		 676 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  50.72 
 
 		 677 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  49.85 
 
 		 672 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  50.45 
 
 		 678 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  47.31 
 
 		 654 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  44.38 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.21 
 
 		 661 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.82 
 
 		 411 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  44.9 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  46.71 
 
 		 560 aa  293  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.98 
 
 		 403 aa  290  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  41.62 
 
 		 604 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  42.9 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  43.23 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  42.46 
 
 		 687 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  42.82 
 
 		 720 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  45.05 
 
 		 558 aa  287  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  45.51 
 
 		 556 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  42.57 
 
 		 672 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  45.65 
 
 		 560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  42.29 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 382 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  46.55 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.64 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  43.24 
 
 		 589 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  43.24 
 
 		 577 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  43.84 
 
 		 559 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  42.34 
 
 		 573 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  44.64 
 
 		 556 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  44.74 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  43.24 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  44.94 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>