126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14780  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  100 
 
 
279 aa  542  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18010  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  56.16 
 
 
308 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0200906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.78 
 
 
286 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1320  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.09 
 
 
296 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.382709  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.43 
 
 
286 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1847  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.94 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.94 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.31 
 
 
278 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.07 
 
 
279 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.9 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.81 
 
 
290 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2039  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.06 
 
 
282 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.57 
 
 
272 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2341  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.82 
 
 
276 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.59 
 
 
273 aa  215  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15600  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  52.73 
 
 
283 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2580  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50 
 
 
270 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0154092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3155  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.49 
 
 
303 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  hitchhiker  0.000202795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12570  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  50.18 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.867374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.08 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3130  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.81 
 
 
292 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  47.91 
 
 
286 aa  192  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0916  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.26 
 
 
303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2665  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.99 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907231  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.09 
 
 
272 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0086  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.38 
 
 
283 aa  183  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2409  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.35 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2368  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.99 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2415  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.99 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.12 
 
 
274 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.13 
 
 
320 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.85 
 
 
359 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1801  orotidine 5-phosphate decarboxylase protein  37.84 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.91 
 
 
272 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.8 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.04 
 
 
314 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.38 
 
 
307 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.55 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.54 
 
 
289 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  30.37 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.83 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.15 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  37.84 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.55 
 
 
267 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.71 
 
 
270 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.86 
 
 
305 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  34.09 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.01 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.24 
 
 
287 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.24 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.58 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.13 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.4 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.73 
 
 
347 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40 
 
 
287 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  36.4 
 
 
513 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.87 
 
 
275 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.95 
 
 
270 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.83 
 
 
264 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.16 
 
 
273 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.72 
 
 
281 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  41.62 
 
 
273 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0347031  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.69 
 
 
306 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.12 
 
 
266 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.69 
 
 
288 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 
264 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  33.07 
 
 
274 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.4 
 
 
274 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.53 
 
 
285 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.26 
 
 
282 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.93 
 
 
278 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.14 
 
 
274 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.94 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.36 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.38 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.47 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.76 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.57 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.42 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.68 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.56 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  34.23 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.34 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.04 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.35 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.39 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  35.07 
 
 
280 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.36 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.39 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.75 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.2 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.89 
 
 
272 aa  92.4  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.9 
 
 
275 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.73 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.73 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.65 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.25 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.93 
 
 
274 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.73 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>