More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1084    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.18 
 
 		 605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  46.13 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 		 574 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  46 
 
 		 574 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.07 
 
 		 584 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  46.99 
 
 		 601 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  45.81 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  43.33 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.67 
 
 		 595 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  44.44 
 
 		 590 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  43.82 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  43.51 
 
 		 616 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  47.12 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  44.73 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.47 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.2 
 
 		 631 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  42.18 
 
 		 570 aa  359  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  43.62 
 
 		 585 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.41 
 
 		 610 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  42.83 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  45.47 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  43.27 
 
 		 578 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  43.27 
 
 		 613 aa  340  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  40.9 
 
 		 617 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  41.56 
 
 		 630 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  41.56 
 
 		 630 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  41.56 
 
 		 630 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.18 
 
 		 595 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  40.14 
 
 		 645 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  43.23 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.47 
 
 		 475 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.94 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  43.78 
 
 		 1442 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  40.19 
 
 		 1407 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  34.85 
 
 		 1447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  38.3 
 
 		 1421 aa  146  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  39.8 
 
 		 970 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  43.41 
 
 		 1397 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  39.8 
 
 		 1433 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  39.8 
 
 		 1433 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  39.8 
 
 		 1433 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  38.07 
 
 		 1433 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  37.44 
 
 		 1390 aa  143  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  39.3 
 
 		 1433 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  39.3 
 
 		 1433 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  40.56 
 
 		 1433 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  39.3 
 
 		 1433 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  39.3 
 
 		 1433 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  39.3 
 
 		 1433 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  39.8 
 
 		 1433 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.28 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  40.22 
 
 		 1449 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  39.67 
 
 		 1449 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  33.47 
 
 		 1367 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  33.47 
 
 		 1367 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  40.11 
 
 		 1402 aa  136  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.51 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  35.59 
 
 		 1426 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  40.39 
 
 		 1444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  44.17 
 
 		 1435 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  37.16 
 
 		 1465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  35.04 
 
 		 1527 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  40.74 
 
 		 315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  42.38 
 
 		 315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  42.38 
 
 		 315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  42.38 
 
 		 315 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  42.38 
 
 		 315 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  41.56 
 
 		 299 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  41.72 
 
 		 315 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  41.72 
 
 		 315 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  41.72 
 
 		 315 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  41.06 
 
 		 315 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.73 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.81 
 
 		 260 aa  127  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  32.37 
 
 		 1436 aa  126  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.86 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  38.66 
 
 		 1440 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.93 
 
 		 449 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  41.06 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.85 
 
 		 921 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  39.02 
 
 		 707 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  40.48 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  31.95 
 
 		 1438 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.77 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  31.95 
 
 		 1438 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  31.47 
 
 		 1362 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  35.02 
 
 		 1365 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 		 205 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.08 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.08 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.67 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.6 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  34.38 
 
 		 379 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.88 
 
 		 180 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.02 
 
 		 715 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  28.83 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  36.05 
 
 		 530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 729 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  33.05 
 
 		 1432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>