More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
436 aa  860  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  44.95 
 
 
445 aa  338  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  44.03 
 
 
438 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  1.56043e-06 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  45.92 
 
 
452 aa  328  1e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  40.6 
 
 
439 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  42.69 
 
 
425 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  40.19 
 
 
441 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  42.19 
 
 
437 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  41.63 
 
 
473 aa  297  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  42.17 
 
 
437 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  42.01 
 
 
447 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  40.89 
 
 
437 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  40.28 
 
 
435 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  38.48 
 
 
434 aa  287  3e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  39.95 
 
 
433 aa  283  5e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  39.57 
 
 
486 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  32.48 
 
 
437 aa  279  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  33.89 
 
 
437 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  33.89 
 
 
434 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  1.5326e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  33.65 
 
 
438 aa  275  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  36.57 
 
 
428 aa  275  1e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  33.18 
 
 
437 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  33.18 
 
 
437 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  38.57 
 
 
470 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  32.94 
 
 
437 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
437 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  32.94 
 
 
437 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  32.7 
 
 
437 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
437 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  38.99 
 
 
475 aa  264  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  39.2 
 
 
432 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  38.36 
 
 
438 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  34.88 
 
 
427 aa  243  4e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.49 
 
 
445 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  34.19 
 
 
460 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  33.56 
 
 
440 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  33.94 
 
 
464 aa  222  1e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  33.72 
 
 
442 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  35.17 
 
 
469 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  32.24 
 
 
424 aa  216  6e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 
464 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  30.25 
 
 
429 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  31.38 
 
 
423 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  29.91 
 
 
412 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  30.59 
 
 
415 aa  197  2e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  31.29 
 
 
415 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  29.98 
 
 
411 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.53 
 
 
415 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  31 
 
 
478 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 
409 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  34.35 
 
 
466 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  31.4 
 
 
439 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  31.15 
 
 
417 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 
449 aa  163  5e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.21 
 
 
418 aa  142  1e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.89 
 
 
574 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  32.06 
 
 
423 aa  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.22 
 
 
437 aa  119  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  37.77 
 
 
424 aa  115  1e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 
418 aa  115  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.82 
 
 
417 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  28.95 
 
 
413 aa  112  2e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  1.42311e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 
430 aa  110  7e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 
446 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  32.46 
 
 
572 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  24.03 
 
 
556 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.85 
 
 
429 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.94 
 
 
448 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  31.25 
 
 
483 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  32.85 
 
 
246 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  37.29 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.56 
 
 
462 aa  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  33.15 
 
 
427 aa  84.3  4e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 
421 aa  84.3  4e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.06 
 
 
504 aa  79.3  1e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.51 
 
 
468 aa  77  5e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.51 
 
 
478 aa  77.4  5e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.51 
 
 
471 aa  77.4  5e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.51 
 
 
478 aa  76.6  9e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  33.51 
 
 
452 aa  76.6  9e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.5 
 
 
474 aa  75.5  2e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.8 
 
 
475 aa  75.1  2e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  26.51 
 
 
471 aa  75.5  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  26.51 
 
 
478 aa  75.1  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  28.92 
 
 
761 aa  75.1  3e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  25.3 
 
 
478 aa  73.9  5e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
490 aa  73.2  8e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  29.03 
 
 
481 aa  73.2  9e-12  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  24.7 
 
 
478 aa  72.4  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.08 
 
 
462 aa  72.8  1e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  25.61 
 
 
478 aa  72  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.36 
 
 
454 aa  72  2e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 
366 aa  71.6  3e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  37.13 
 
 
752 aa  70.9  5e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
758 aa  70.1  7e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.16 
 
 
734 aa  69.3  1e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 
433 aa  68.2  3e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  36.51 
 
 
472 aa  68.2  3e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.73 
 
 
473 aa  68.2  3e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  32.05 
 
 
477 aa  68.2  3e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>