188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12930 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  487  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  49.55 
 
 
218 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  46.85 
 
 
220 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  45.25 
 
 
218 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  47.79 
 
 
217 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  45.5 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  48.46 
 
 
207 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  44.8 
 
 
212 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  44.05 
 
 
212 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  43.58 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  43.52 
 
 
203 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  43.52 
 
 
203 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  43.52 
 
 
203 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  44.55 
 
 
212 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  44.09 
 
 
212 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  42.67 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  43.72 
 
 
214 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  52.1 
 
 
207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  45.74 
 
 
213 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  45.74 
 
 
219 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  44.97 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  46.98 
 
 
203 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  39.64 
 
 
213 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  45.18 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  55.75 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  44.19 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  44.65 
 
 
206 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  32.2 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  33.91 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  33.79 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.91 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  30.74 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  31.91 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  40.91 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  33.66 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  33.72 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  39.62 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  32.74 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  40.82 
 
 
220 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  41.41 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  38.1 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  36.89 
 
 
216 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  30.63 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  39.81 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  37.76 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  30.04 
 
 
223 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  38.78 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  34.55 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  27.83 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  35.45 
 
 
231 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  27.51 
 
 
228 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  38.14 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  39.8 
 
 
220 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  38.14 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
196 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  30.6 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  32.2 
 
 
223 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
196 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  28.87 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  33.8 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  32.26 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  35.66 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  32.75 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  31.43 
 
 
142 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  25.69 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  37.76 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  37.62 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  37.76 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  36.73 
 
 
220 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  30.9 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  37.04 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  38.78 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  36.73 
 
 
220 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  36.73 
 
 
220 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  31.11 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  39.22 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  36.46 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  31.11 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  28.7 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  33.95 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  30.12 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  34.29 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  34.29 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  34.29 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  37.62 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  34.92 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  34.29 
 
 
230 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  37 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  35.29 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  28.3 
 
 
201 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  32.58 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>