More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  53.15 
 
 		 717 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.35 
 
 		 699 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  53.46 
 
 		 701 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.13 
 
 		 709 aa  661    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  53 
 
 		 726 aa  695    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 710 aa  1425    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  53.9 
 
 		 684 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  47.2 
 
 		 787 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  48.99 
 
 		 702 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  54.14 
 
 		 670 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  51.54 
 
 		 682 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.36 
 
 		 704 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  48.78 
 
 		 708 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  48.7 
 
 		 712 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  52.86 
 
 		 685 aa  609  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.64 
 
 		 689 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  50.79 
 
 		 688 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  48.07 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  49 
 
 		 719 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  48.99 
 
 		 674 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  47.09 
 
 		 697 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  46.51 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  47.79 
 
 		 719 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  48.37 
 
 		 707 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  47.7 
 
 		 710 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  47.59 
 
 		 736 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  48.23 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  48.23 
 
 		 707 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  46.31 
 
 		 700 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  48.34 
 
 		 685 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.6 
 
 		 694 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  46.11 
 
 		 707 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  45.67 
 
 		 717 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  45.72 
 
 		 759 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  52.72 
 
 		 876 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  39.86 
 
 		 643 aa  326  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  36.06 
 
 		 515 aa  302  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  43.05 
 
 		 508 aa  279  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.38 
 
 		 794 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 731 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.39 
 
 		 689 aa  263  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  28.94 
 
 		 706 aa  256  9e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 625 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  33.18 
 
 		 721 aa  251  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  32.06 
 
 		 726 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 722 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  29.5 
 
 		 722 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  33.08 
 
 		 726 aa  248  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  29.36 
 
 		 722 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.4 
 
 		 726 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 724 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.35 
 
 		 718 aa  243  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 		 735 aa  243  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  32.22 
 
 		 804 aa  240  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  31.29 
 
 		 790 aa  237  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  30.47 
 
 		 620 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  35.8 
 
 		 689 aa  234  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.91 
 
 		 686 aa  233  9e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.65 
 
 		 851 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  30.89 
 
 		 727 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 735 aa  231  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  30.65 
 
 		 727 aa  230  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 666 aa  230  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  31.34 
 
 		 641 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  29.41 
 
 		 720 aa  226  8e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.25 
 
 		 711 aa  226  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  35.99 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.79 
 
 		 757 aa  226  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  31.97 
 
 		 807 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.61 
 
 		 932 aa  225  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.65 
 
 		 795 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  28.64 
 
 		 630 aa  224  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.25 
 
 		 858 aa  224  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  32.01 
 
 		 727 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  31.45 
 
 		 729 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.83 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 681 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 847 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  29.26 
 
 		 723 aa  221  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.17 
 
 		 755 aa  220  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 655 aa  220  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  29.07 
 
 		 721 aa  220  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.17 
 
 		 741 aa  220  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  29.08 
 
 		 722 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.7 
 
 		 729 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.46 
 
 		 876 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.04 
 
 		 756 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.79 
 
 		 833 aa  219  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.17 
 
 		 715 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  32.61 
 
 		 714 aa  218  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.87 
 
 		 706 aa  217  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 833 aa  217  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.05 
 
 		 762 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  30.61 
 
 		 728 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  28.71 
 
 		 722 aa  217  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  29.52 
 
 		 858 aa  216  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  32.85 
 
 		 1050 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.05 
 
 		 781 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  30.46 
 
 		 728 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 770 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>