More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.29 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 195 aa  91.7  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  43.12 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  58.06 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  48.75 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  55.93 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  45.21 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 497 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  33.53 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  44.59 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>