More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10850 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  100 
 
 
244 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  48.88 
 
 
224 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  51.74 
 
 
238 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.64 
 
 
255 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  51.32 
 
 
238 aa  184  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  45.45 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  46.34 
 
 
241 aa  178  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.05 
 
 
234 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  48.88 
 
 
227 aa  175  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  45.58 
 
 
229 aa  174  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  45.78 
 
 
235 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  45.85 
 
 
252 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  46.86 
 
 
229 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  46.58 
 
 
239 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  47.41 
 
 
261 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  45.61 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  45.61 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  46.89 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  45.61 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  47.56 
 
 
228 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  46.22 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  44.78 
 
 
253 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  48.03 
 
 
243 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  48.54 
 
 
251 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  47.46 
 
 
241 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  45.85 
 
 
236 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  43.91 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  38.16 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  41.02 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  44.54 
 
 
250 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  49.77 
 
 
273 aa  141  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  38.56 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  38.33 
 
 
233 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  41.77 
 
 
242 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  37.66 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  36.29 
 
 
246 aa  131  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.13 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  34.51 
 
 
229 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  40.68 
 
 
245 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  36.55 
 
 
244 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  33.98 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  38.1 
 
 
260 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  33.49 
 
 
240 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  35.16 
 
 
321 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  37.2 
 
 
248 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  44.21 
 
 
260 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  33.7 
 
 
326 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  41.03 
 
 
243 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.93 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  36.29 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  36.02 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  37.76 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.62 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  41.33 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  32.02 
 
 
263 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  40.45 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  37.14 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  39.82 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  40.09 
 
 
252 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.62 
 
 
242 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  34.32 
 
 
263 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  118  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  37.23 
 
 
251 aa  118  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  34.02 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  35.66 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  42.51 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.56 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  39.66 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  37.29 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  38.8 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  39.22 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  38.26 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  39.32 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  33.61 
 
 
241 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  40.57 
 
 
259 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  38.1 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  38.71 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  39.82 
 
 
283 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  39.91 
 
 
240 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  37.89 
 
 
275 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  39.82 
 
 
265 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  34.82 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  38.1 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  37.9 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  39.19 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  36.1 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  43.35 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  39.29 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.9 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  41.32 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1590  protein of unknown function DUF152  41.2 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.840086  normal  0.0159691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  35.27 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.71 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.71 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  38.1 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>