More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  100 
 
 
673 aa  1333    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  52.04 
 
 
690 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  54.72 
 
 
672 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  51.68 
 
 
706 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  51.2 
 
 
765 aa  606  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  51.48 
 
 
685 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  51.53 
 
 
696 aa  588  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  49.35 
 
 
674 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  50.15 
 
 
681 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  50.43 
 
 
728 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  49.49 
 
 
692 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.29 
 
 
694 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  50.36 
 
 
679 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  50.44 
 
 
684 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.56 
 
 
666 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  52.44 
 
 
676 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  48.98 
 
 
699 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  50 
 
 
699 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  49.93 
 
 
699 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  48.24 
 
 
669 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  49.62 
 
 
683 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  50.89 
 
 
677 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  47.81 
 
 
664 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  51.19 
 
 
670 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  50.91 
 
 
665 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  50.91 
 
 
665 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  50.91 
 
 
665 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  51.68 
 
 
676 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.76 
 
 
706 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  49.16 
 
 
664 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  47.19 
 
 
710 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.84 
 
 
674 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  35.79 
 
 
639 aa  293  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.18 
 
 
641 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.73 
 
 
660 aa  289  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  33.78 
 
 
634 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.48 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  46.85 
 
 
844 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.78 
 
 
636 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.98 
 
 
651 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.78 
 
 
636 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.78 
 
 
636 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.78 
 
 
636 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.78 
 
 
636 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.78 
 
 
636 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.1 
 
 
646 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.78 
 
 
636 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.78 
 
 
636 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  33.75 
 
 
649 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.63 
 
 
636 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  31.83 
 
 
636 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  31.83 
 
 
636 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.13 
 
 
636 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.16 
 
 
658 aa  277  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  31.83 
 
 
636 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  31.83 
 
 
636 aa  277  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  32.53 
 
 
640 aa  276  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.13 
 
 
650 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.3 
 
 
644 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.87 
 
 
832 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.48 
 
 
639 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.79 
 
 
646 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  33.19 
 
 
634 aa  273  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  32.57 
 
 
636 aa  273  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  32.98 
 
 
650 aa  273  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.75 
 
 
634 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.09 
 
 
639 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  31.26 
 
 
725 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.45 
 
 
647 aa  272  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.75 
 
 
634 aa  272  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.12 
 
 
707 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.47 
 
 
651 aa  272  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.19 
 
 
645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  30.68 
 
 
725 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  34.62 
 
 
649 aa  271  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.79 
 
 
952 aa  270  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  30.48 
 
 
713 aa  270  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  30.56 
 
 
754 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  34.37 
 
 
664 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.48 
 
 
639 aa  265  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  32.15 
 
 
665 aa  264  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  30.71 
 
 
646 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  30.4 
 
 
636 aa  262  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  34.32 
 
 
649 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  30.69 
 
 
641 aa  260  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  31.25 
 
 
749 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.48 
 
 
652 aa  259  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  31.28 
 
 
755 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.5 
 
 
659 aa  259  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  30.84 
 
 
646 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  28.84 
 
 
636 aa  258  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  30.1 
 
 
743 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  30.57 
 
 
664 aa  257  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  32.11 
 
 
641 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  32.11 
 
 
641 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  33.84 
 
 
675 aa  256  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  31.3 
 
 
757 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  33.58 
 
 
633 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  32.27 
 
 
647 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  29.63 
 
 
641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>