153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  100 
 
 		 388 aa  754    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  49.31 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.47 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  55 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  53.19 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  52.45 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  53.31 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  52.08 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  48.6 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  49.86 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  49.46 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  49.44 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  50.69 
 
 		 361 aa  295  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  48.32 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  47.51 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  47.7 
 
 		 368 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  47.7 
 
 		 368 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  50.28 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  47.7 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  46.5 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  48.07 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  48.12 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  49.1 
 
 		 367 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  45.3 
 
 		 362 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  47.09 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  48.92 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  44.74 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  43.1 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.53 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  26.99 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  25 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  25 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  25 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  26.89 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  26.89 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  26.89 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  24.24 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  25.16 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.21 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.42 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  26.56 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.5 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.48 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.22 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  24.13 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.92 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  29.75 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.56 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.89 
 
 		 459 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.8 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  26.23 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  25.49 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  28.29 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.32 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  30.46 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.45 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  25.92 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.66 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.21 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  26.18 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.65 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.79 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  22.43 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  27.45 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.31 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.24 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  25.74 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  24.44 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.4 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.41 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  23.82 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  24.41 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.88 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  25.66 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  25.9 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25.21 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.71 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  25.85 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.55 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  29.21 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  24.31 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  25.96 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  26.19 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.27 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  28.97 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  25.93 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  24.26 
 
 		 692 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  26.6 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  29.31 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  27.13 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  25.13 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.43 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  32.55 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  24.54 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  28.87 
 
 		 422 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.79 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  26.63 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.47 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  24.94 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>