More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 877 aa  1058    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 876 aa  1075    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 885 aa  1054    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 855 aa  832    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 881 aa  1090    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  61.61 
 
 		 886 aa  1111    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 		 902 aa  1070    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  61.39 
 
 		 916 aa  1103    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  61.41 
 
 		 846 aa  1068    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 862 aa  1015    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 895 aa  1830    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 860 aa  1024    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 845 aa  1043    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 903 aa  1045    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 		 872 aa  1034    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  60.7 
 
 		 836 aa  1029    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 911 aa  1002    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  60.87 
 
 		 858 aa  1022    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  55.32 
 
 		 925 aa  963    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  61.04 
 
 		 861 aa  1086    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 873 aa  1046    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 894 aa  1063    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 871 aa  954    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 906 aa  1094    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  61.25 
 
 		 901 aa  1096    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 864 aa  577  1.0000000000000001e-163  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 802 aa  551  1e-155  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 808 aa  546  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 896 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 928 aa  507  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 892 aa  489  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 908 aa  479  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 905 aa  466  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 863 aa  452  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 864 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 863 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 855 aa  428  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 865 aa  422  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 858 aa  422  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 906 aa  414  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 886 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 865 aa  412  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 886 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 886 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 869 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 886 aa  403  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 809 aa  399  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 865 aa  395  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 799 aa  372  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 799 aa  369  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 799 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 771 aa  360  5e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 808 aa  353  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 806 aa  348  2e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 816 aa  345  2e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 877 aa  338  1.9999999999999998e-91  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 883 aa  296  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 882 aa  292  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 904 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 947 aa  288  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 893 aa  283  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 872 aa  280  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 877 aa  279  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 891 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 917 aa  278  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 883 aa  278  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 885 aa  278  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 882 aa  277  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 861 aa  277  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 883 aa  276  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 872 aa  276  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 911 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 882 aa  276  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 894 aa  274  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 897 aa  275  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 900 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 909 aa  272  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 876 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 883 aa  271  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 883 aa  271  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 883 aa  270  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 1002 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 909 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 882 aa  270  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2053  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 884 aa  270  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0948742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 		 883 aa  269  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 933 aa  269  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 925 aa  268  5e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 909 aa  267  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 		 879 aa  266  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 909 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 886 aa  266  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 881 aa  265  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 926 aa  265  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 955 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 933 aa  264  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 1006 aa  263  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 879 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 933 aa  263  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>