120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  100 
 
 
120 aa  237  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  61.26 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  75 
 
 
114 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  63 
 
 
111 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  65.91 
 
 
106 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  65.91 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  54.87 
 
 
119 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  74.07 
 
 
104 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  62.5 
 
 
114 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  65.59 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  62.11 
 
 
115 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  62.11 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  63.53 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  67.07 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  66.67 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  61.54 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  70.89 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  69.14 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  61.11 
 
 
99 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  61.11 
 
 
99 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  67.9 
 
 
115 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  65.88 
 
 
129 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  65.48 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  62.5 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  61.36 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  57.14 
 
 
98 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  58.24 
 
 
102 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  61.36 
 
 
94 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  64.1 
 
 
96 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  72.15 
 
 
104 aa  103  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  72.15 
 
 
104 aa  103  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  60.98 
 
 
98 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  59.3 
 
 
105 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  60.71 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  49.53 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  46.34 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  37.37 
 
 
97 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
375 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.18 
 
 
377 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.67 
 
 
358 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.18 
 
 
384 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 
374 aa  53.9  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  42.86 
 
 
375 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  32.99 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  39.71 
 
 
375 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.67 
 
 
358 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
381 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.33 
 
 
358 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  39.73 
 
 
373 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  39.73 
 
 
373 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  39.51 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.27 
 
 
475 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  35.71 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1269  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  43.64 
 
 
358 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 
375 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.01 
 
 
379 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40.28 
 
 
375 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  38.36 
 
 
373 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
383 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  38.36 
 
 
373 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
383 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 
383 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 
383 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
373 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  35 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  35.11 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  27.27 
 
 
367 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.73 
 
 
384 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 
384 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  32.89 
 
 
333 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  33.33 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  33.33 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.73 
 
 
379 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1647  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40 
 
 
359 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.639332  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.53 
 
 
379 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  33.33 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  30.39 
 
 
386 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.76 
 
 
373 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  35 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  30.12 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.53 
 
 
383 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>