More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1403  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0042  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0044  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0741323  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0024  tRNA-Gly  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0085  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0843991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0039  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0089  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.548412  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0058  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0062  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0121694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0041  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.771709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>