More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  100 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  59.79 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  51.63 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  50.82 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  51.45 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  49.73 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  48.63 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  48.96 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  51.46 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  47.92 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  47.4 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  47.4 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  47.4 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  47.4 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  50 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  49.1 
 
 		 221 aa  131  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  45.6 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  43.16 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  46.15 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  46.51 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  44.71 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  44.23 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  43.71 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  45.83 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  40.59 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  44.64 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  45.35 
 
 		 162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  45.93 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  48.47 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  46.58 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  39.89 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  42.35 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  42.35 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  38.86 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  46.71 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  44.64 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.18 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.6 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  42.69 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  47.62 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  44.57 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  41.18 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  46.78 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  40 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  45.96 
 
 		 227 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  41.76 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  40.12 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  44.19 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  43.27 
 
 		 219 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  39.22 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.59 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.18 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.47 
 
 		 147 aa  104  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  42.76 
 
 		 167 aa  104  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  41.18 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  49.35 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  38.73 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  47.55 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  39.1 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  42.93 
 
 		 230 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  38.24 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  39.13 
 
 		 199 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  43.11 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  43.92 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  40.99 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  39.53 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  44.2 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  39.38 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  36.65 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  40.38 
 
 		 167 aa  98.6  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  46.62 
 
 		 171 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.46 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  38.24 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  36.69 
 
 		 178 aa  97.8  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  42.95 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  34.88 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  39.87 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  41.46 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  37.85 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  40.29 
 
 		 169 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  32.92 
 
 		 169 aa  95.1  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.01 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  37.42 
 
 		 154 aa  94.4  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  42.58 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  41.94 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  37.42 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  38.89 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.89 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  35.26 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  38.36 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  35.59 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  34.9 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  39.88 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  37.27 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  38.89 
 
 		 153 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  42.2 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  37.74 
 
 		 150 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  35.95 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  38.51 
 
 		 171 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  38.51 
 
 		 171 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>