More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 
226 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 
232 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  46.23 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  45.91 
 
 
222 aa  169  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  44.6 
 
 
215 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  43.66 
 
 
214 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  44.81 
 
 
219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  41.98 
 
 
217 aa  161  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  42.52 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  44.81 
 
 
223 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 
219 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.59 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  42.18 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  39.34 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  41.26 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.44 
 
 
220 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  36.02 
 
 
220 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.57 
 
 
226 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  41.51 
 
 
219 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  39.22 
 
 
224 aa  138  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  40.38 
 
 
238 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  41.59 
 
 
225 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  41.98 
 
 
218 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  39.07 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.99 
 
 
220 aa  131  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  40.76 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  37.44 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 
216 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 
220 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 
222 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  35.85 
 
 
221 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
214 aa  111  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  31.98 
 
 
216 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 
218 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  26.51 
 
 
233 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 
215 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  35.85 
 
 
222 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  25.12 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  33.63 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  27.7 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0956  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  29.55 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  33.78 
 
 
225 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  26.29 
 
 
220 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  29.09 
 
 
240 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  32.41 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.33 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  30.22 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  29.55 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.51 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  26.54 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  26.64 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.51 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  28.17 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  29.15 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  31 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
231 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  24.65 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  31.08 
 
 
219 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  28.09 
 
 
240 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  28.3 
 
 
218 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 
239 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 
216 aa  89  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 
227 aa  89  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 
233 aa  88.6  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
233 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.54 
 
 
213 aa  88.2  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  30.6 
 
 
240 aa  88.2  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  26.54 
 
 
213 aa  88.2  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.17 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  28.17 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.3 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.64 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.3 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  31.16 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.64 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 
217 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  24.17 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  28.17 
 
 
238 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  29.28 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>