157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09150 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
277 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0814  methyltransferase type 11  47.2 
 
 
293 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  50.19 
 
 
309 aa  188  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  49.62 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  44.88 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0758  methyltransferase type 11  46.71 
 
 
295 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  43.85 
 
 
326 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  48.85 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.92 
 
 
279 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  40.96 
 
 
311 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2268  rRNA guanine-N1-methyltransferase  46.34 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  45.45 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  41.26 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1348  Methyltransferase type 11  48.37 
 
 
287 aa  161  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0109621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  40.99 
 
 
281 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  47.7 
 
 
281 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  42.48 
 
 
283 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  44.03 
 
 
292 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000111117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  45.42 
 
 
285 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  46.12 
 
 
282 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  45.12 
 
 
281 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  41 
 
 
267 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.26 
 
 
270 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.26 
 
 
270 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3307  Methyltransferase type 11  37.83 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4184  Methyltransferase type 11  48.23 
 
 
225 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  39.46 
 
 
267 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  34.8 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.34 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  29.78 
 
 
271 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  34.8 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  35.66 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  34.8 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  35.34 
 
 
269 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  34.8 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  35.34 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41 
 
 
270 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  34.94 
 
 
269 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.26 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  39.33 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.91 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  33.69 
 
 
273 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  34.96 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  34.9 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  35.74 
 
 
269 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  35.74 
 
 
269 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  35.74 
 
 
269 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.92 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  34.36 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1726  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  28.19 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.66 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.47 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  31.3 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.84 
 
 
274 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.8 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  32.73 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  31.54 
 
 
279 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  31.54 
 
 
279 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  31.54 
 
 
279 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  39.25 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  30.19 
 
 
269 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  30.15 
 
 
275 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  32.93 
 
 
271 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  33.22 
 
 
290 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  33.6 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  32.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  36.46 
 
 
271 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  33.2 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  34.68 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  33.61 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  33.91 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  29.71 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  33.2 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  33.33 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  27.65 
 
 
285 aa  112  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.63 
 
 
285 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.09 
 
 
320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  33.98 
 
 
282 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  32.94 
 
 
286 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  38.91 
 
 
282 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.1 
 
 
283 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  31.41 
 
 
313 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  38.15 
 
 
283 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  32.45 
 
 
277 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.13 
 
 
313 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.37 
 
 
282 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  37.56 
 
 
271 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  29.96 
 
 
271 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  33.16 
 
 
270 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.4 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  33 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2254  SAM-dependent methyltransferase  25.62 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  37.1 
 
 
279 aa  95.5  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  26.39 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.3 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000007859  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>