More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  100 
 
 
98 aa  194  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  75.26 
 
 
97 aa  157  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  78.12 
 
 
98 aa  154  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  75 
 
 
97 aa  153  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
98 aa  153  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  74.23 
 
 
98 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  73.96 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  72.16 
 
 
97 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  149  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  75.26 
 
 
98 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  74.47 
 
 
102 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  74.47 
 
 
98 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  72.16 
 
 
97 aa  147  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  73.96 
 
 
98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  73.4 
 
 
102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  75.27 
 
 
103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  72.34 
 
 
102 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  74.47 
 
 
102 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  72.34 
 
 
104 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
101 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  70.83 
 
 
103 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  70.83 
 
 
98 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  69.07 
 
 
127 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  69.07 
 
 
127 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  69.07 
 
 
127 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
101 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
99 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
103 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  67.01 
 
 
100 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  67.01 
 
 
100 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  62.5 
 
 
97 aa  135  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
99 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
99 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  68.75 
 
 
96 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
95 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 
94 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 
94 aa  120  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
94 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
94 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 
94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 
100 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
96 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 
96 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
96 aa  116  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  59.79 
 
 
103 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
98 aa  114  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  57.14 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  55.1 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  58.24 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
104 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 
104 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
101 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
96 aa  111  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
94 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  53.12 
 
 
103 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
103 aa  110  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 
103 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
98 aa  110  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
101 aa  110  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 
103 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
94 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
94 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
103 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  56.12 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  57.14 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>