240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.63 
 
 
981 aa  767  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.65 
 
 
972 aa  886  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.87 
 
 
928 aa  879  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.84 
 
 
940 aa  877  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.75 
 
 
954 aa  808  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
942 aa  1889  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  61.53 
 
 
937 aa  1045  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.67 
 
 
945 aa  979  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.4 
 
 
954 aa  1060  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  53.02 
 
 
914 aa  823  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.32 
 
 
929 aa  559  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 
931 aa  542  1e-152  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.37 
 
 
906 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.22 
 
 
952 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.87 
 
 
1002 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.48 
 
 
926 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.59 
 
 
1001 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.89 
 
 
1009 aa  506  1e-142  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.74 
 
 
929 aa  508  1e-142  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.3 
 
 
883 aa  509  1e-142  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.18 
 
 
928 aa  508  1e-142  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.65 
 
 
1030 aa  509  1e-142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 
998 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 
998 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.89 
 
 
994 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.34 
 
 
1021 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.1 
 
 
985 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.37 
 
 
1009 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.43 
 
 
933 aa  506  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.76 
 
 
1008 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.05 
 
 
939 aa  506  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 
929 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.34 
 
 
994 aa  502  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.75 
 
 
938 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.34 
 
 
920 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
1075 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.78 
 
 
1004 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.25 
 
 
957 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.31 
 
 
882 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.78 
 
 
995 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00045  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.09 
 
 
888 aa  496  1e-138  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.6 
 
 
883 aa  493  1e-138  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 
1007 aa  494  1e-138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.17 
 
 
1023 aa  495  1e-138  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
1088 aa  493  1e-138  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 
994 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.56 
 
 
1002 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.69 
 
 
1018 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
994 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
1024 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.27 
 
 
887 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
1085 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 
994 aa  492  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.49 
 
 
928 aa  490  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
994 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
994 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
994 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
994 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.4 
 
 
1024 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 
1009 aa  489  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 
937 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 
933 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002310  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.22 
 
 
877 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 
936 aa  489  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.4 
 
 
1024 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.46 
 
 
889 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.67 
 
 
889 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 
933 aa  486  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 
1017 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.67 
 
 
889 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.24 
 
 
889 aa  485  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.35 
 
 
989 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 
1038 aa  486  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.87 
 
 
889 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 
883 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.02 
 
 
881 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 
912 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.91 
 
 
883 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 
989 aa  482  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.29 
 
 
950 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.09332e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
889 aa  482  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
889 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 
989 aa  482  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 
883 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 
883 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.02 
 
 
889 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
883 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2754  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.59 
 
 
876 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
883 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.62 
 
 
883 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
883 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
883 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
883 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
883 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  34.9 
 
 
883 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.3 
 
 
947 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.58 
 
 
989 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.3 
 
 
946 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.62 
 
 
883 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  37 
 
 
936 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>