More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.63 
 
 		 1331 aa  1196    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.07 
 
 		 1176 aa  865    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.79 
 
 		 1891 aa  1127    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  50 
 
 		 1855 aa  680    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.04 
 
 		 946 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.14 
 
 		 2068 aa  1047    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.4 
 
 		 1117 aa  691    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 		 1248 aa  2508    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  49.45 
 
 		 1025 aa  911    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  48.41 
 
 		 1942 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.73 
 
 		 891 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.7 
 
 		 1975 aa  1064    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  41.46 
 
 		 991 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  40.71 
 
 		 1329 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  40.69 
 
 		 1328 aa  618  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.15 
 
 		 1035 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.85 
 
 		 2156 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.21 
 
 		 1124 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  38.86 
 
 		 998 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  38.47 
 
 		 1062 aa  543  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.72 
 
 		 1440 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.61 
 
 		 1440 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  35.9 
 
 		 1432 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  34.89 
 
 		 1441 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  40.39 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  34.14 
 
 		 1472 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  33.87 
 
 		 1450 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  34.85 
 
 		 1429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  28.69 
 
 		 655 aa  273  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  32.23 
 
 		 1043 aa  271  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.14 
 
 		 655 aa  265  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  30.55 
 
 		 852 aa  255  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  30.38 
 
 		 852 aa  253  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  30.22 
 
 		 850 aa  253  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  30.36 
 
 		 848 aa  253  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  30.38 
 
 		 852 aa  253  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.2 
 
 		 852 aa  251  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  32.1 
 
 		 718 aa  250  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  27.05 
 
 		 647 aa  249  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  28.59 
 
 		 1136 aa  247  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.85 
 
 		 2638 aa  240  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  27.6 
 
 		 640 aa  239  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  30.36 
 
 		 848 aa  238  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  30.19 
 
 		 856 aa  236  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  30.07 
 
 		 852 aa  234  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  29.56 
 
 		 852 aa  234  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  29.26 
 
 		 825 aa  225  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.14 
 
 		 843 aa  224  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  27.56 
 
 		 874 aa  224  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.15 
 
 		 1888 aa  221  7.999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  26.93 
 
 		 1064 aa  221  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  26.92 
 
 		 843 aa  218  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  28.34 
 
 		 928 aa  218  8e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  26.59 
 
 		 1064 aa  217  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  27.86 
 
 		 712 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  27.63 
 
 		 713 aa  214  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  27.07 
 
 		 713 aa  210  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  28.53 
 
 		 842 aa  207  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  27.22 
 
 		 713 aa  206  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  27.08 
 
 		 713 aa  206  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  27.22 
 
 		 713 aa  206  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  27.49 
 
 		 713 aa  206  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  26.67 
 
 		 713 aa  205  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  29.02 
 
 		 899 aa  204  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  28.07 
 
 		 713 aa  204  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  26.67 
 
 		 713 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.81 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  29.11 
 
 		 841 aa  199  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.93 
 
 		 640 aa  194  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  27.66 
 
 		 601 aa  190  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27.84 
 
 		 766 aa  184  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  27.55 
 
 		 669 aa  176  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  40.97 
 
 		 1401 aa  167  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  24.73 
 
 		 776 aa  164  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  40.2 
 
 		 1017 aa  150  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 		 1401 aa  146  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  23.32 
 
 		 1252 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  40.5 
 
 		 1005 aa  142  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  25.04 
 
 		 701 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  27.38 
 
 		 711 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  27.97 
 
 		 711 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  25 
 
 		 726 aa  118  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  26.87 
 
 		 701 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  27.4 
 
 		 703 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  27.16 
 
 		 706 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  24.95 
 
 		 700 aa  111  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  26.2 
 
 		 720 aa  111  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  26.78 
 
 		 709 aa  111  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  26.9 
 
 		 721 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  26.42 
 
 		 730 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  26.54 
 
 		 710 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  31.16 
 
 		 708 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  29.79 
 
 		 718 aa  110  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  22.96 
 
 		 845 aa  109  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  24.8 
 
 		 802 aa  109  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  32.22 
 
 		 709 aa  109  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  25.22 
 
 		 710 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  23.91 
 
 		 1464 aa  109  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  31.86 
 
 		 701 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  23.72 
 
 		 788 aa  108  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>