91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  100 
 
 		 561 aa  1117    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  87.8 
 
 		 577 aa  923    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  43.61 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  41.96 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  42.22 
 
 		 521 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  42.51 
 
 		 360 aa  187  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  40.94 
 
 		 553 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.99 
 
 		 567 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  35.78 
 
 		 603 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.94 
 
 		 426 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  39.06 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  39.68 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  39.37 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  33.33 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 748 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 602 aa  85.1  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  38.58 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  37.69 
 
 		 620 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 605 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.01 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  38.27 
 
 		 628 aa  81.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  39.68 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  40.94 
 
 		 535 aa  80.5  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  38.73 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  36.08 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  32.64 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  39.83 
 
 		 551 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  38.35 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  38.02 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  35.2 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  35.2 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  41.9 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  37.19 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  34.51 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  44 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  27.19 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  36.67 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 198 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  35.09 
 
 		 169 aa  54.3  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 620 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  25.63 
 
 		 434 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  33.14 
 
 		 433 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  25.63 
 
 		 434 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  32.76 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  27.18 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  26.51 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 434 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  35.78 
 
 		 565 aa  50.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 743 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  32.73 
 
 		 433 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  33.09 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  25.16 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  31.46 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  31.46 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.09 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  40.3 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  33.08 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  33.77 
 
 		 572 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  32.12 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  32.47 
 
 		 602 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  40 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  35.82 
 
 		 593 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  31.39 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  35.82 
 
 		 593 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  25.42 
 
 		 474 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  32.47 
 
 		 557 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 535 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  33.58 
 
 		 480 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  35.82 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  35.82 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  30.15 
 
 		 405 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  36.23 
 
 		 480 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  36.23 
 
 		 480 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  32.47 
 
 		 545 aa  43.9  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>