231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  100 
 
 
475 aa  946    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  27.91 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  27.91 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
431 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
963 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
774 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 
652 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
463 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 
432 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.71 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.51 
 
 
1454 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.49 
 
 
653 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.31 
 
 
475 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  28.29 
 
 
415 aa  93.6  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 
536 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
795 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.49 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  24.05 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 
687 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.82 
 
 
484 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  22.39 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.61 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  27.05 
 
 
901 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  30.14 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.53 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.17 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  27.71 
 
 
809 aa  77  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  20.99 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.31 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.05 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.25 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.49 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.83 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  25.39 
 
 
1311 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.83 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.35 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  28.47 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.42 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.69 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.42 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  23.16 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.16 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  23.16 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.16 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.16 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.16 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.89 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1981  PQQ enzyme repeat protein  21.03 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.89 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.16 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1649  Pyrrolo-quinoline quinone  21.03 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000205987  normal  0.0168641 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.6 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.01 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.89 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.59 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.4 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.51 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  28.33 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  24.93 
 
 
461 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  26.54 
 
 
1328 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 
411 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  22.95 
 
 
407 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
371 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.92 
 
 
1241 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.96 
 
 
393 aa  63.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.59 
 
 
395 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  27.41 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.64 
 
 
395 aa  63.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.88 
 
 
395 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  24.6 
 
 
834 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 
365 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 
514 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  29.32 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24.21 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.67 
 
 
441 aa  63.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  28.25 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.11 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.4 
 
 
350 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  24.4 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.2 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.42 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  24.05 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  24.86 
 
 
371 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.21 
 
 
379 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  23.8 
 
 
381 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  22.74 
 
 
455 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  23.06 
 
 
2122 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.83 
 
 
395 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.78 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  23.78 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.17 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  23.78 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  23.78 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.8 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>