More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05510 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  768    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.66 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  37.17 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.94 
 
 		 430 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  36.8 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.79 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  36.41 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.44 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.85 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.13 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.91 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  33.02 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.93 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.84 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  39.08 
 
 		 397 aa  136  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.44 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.01 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  36.04 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.52 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.95 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  31.37 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  25.71 
 
 		 377 aa  116  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  31.34 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.6 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.91 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.75 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.77 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.68 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.57 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.06 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.36 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  34 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.22 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.8 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.23 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.39 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.97 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.39 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.85 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.76 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  33.49 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  28.48 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.09 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.14 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.18 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.25 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.29 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.91 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.07 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.5 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.66 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.2 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.13 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  25.79 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.48 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.11 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  22.32 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  34.25 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.7 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  27.62 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.03 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.23 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  32.02 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.23 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.68 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.05 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  32.45 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  28 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.76 
 
 		 507 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  31 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.18 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  28.06 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.9 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.72 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  24.23 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  24.83 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  25.33 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.64 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.75 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  28.05 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.14 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  27.64 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  29.8 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  24.54 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.95 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  29.59 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  29.8 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.54 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  33.86 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  37.23 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.52 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>