30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  721  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  25.63 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.07578e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  30.53 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  25 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  29.27 
 
 
348 aa  85.5  1e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  29.24 
 
 
401 aa  83.6  5e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  28.02 
 
 
432 aa  81.6  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  25.99 
 
 
427 aa  77.8  2e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  23.46 
 
 
415 aa  75.9  1e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  30.18 
 
 
372 aa  74.3  3e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6475e-06 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  27.98 
 
 
373 aa  73.6  5e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  27.37 
 
 
497 aa  69.3  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  27.71 
 
 
392 aa  63.2  7e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  22.81 
 
 
365 aa  54.7  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  21.16 
 
 
375 aa  52.8  9e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  22 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  24.45 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  21.67 
 
 
443 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  23.11 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  22.88 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  24.29 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  23.18 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  22.78 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2513  hypothetical protein  26.06 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2478  hypothetical protein  26.06 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000608339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2751  hypothetical protein  26.06 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.82894e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2743  hypothetical protein  26.06 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2557  hypothetical protein  26.06 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000442188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  19.57 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  29.05 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>