More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00370  transposase  100 
 
 
303 aa  614  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  100 
 
 
303 aa  614  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  99.67 
 
 
303 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  47.06 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  42.62 
 
 
294 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  58.72 
 
 
177 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  56.57 
 
 
184 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  56.57 
 
 
184 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.54 
 
 
281 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.54 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.86 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.54 
 
 
281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  37.84 
 
 
252 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  69.4 
 
 
136 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  37.67 
 
 
253 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  37.67 
 
 
253 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  37.67 
 
 
253 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  37.67 
 
 
253 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  35.86 
 
 
260 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  34.46 
 
 
252 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  34.72 
 
 
255 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  36.64 
 
 
253 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  37.13 
 
 
260 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  37.13 
 
 
260 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  36.76 
 
 
273 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  35.22 
 
 
253 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  35.14 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  35.14 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  50.28 
 
 
287 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  34.88 
 
 
253 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  34.88 
 
 
253 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  36.95 
 
 
254 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  36.95 
 
 
254 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  36.95 
 
 
254 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  36.95 
 
 
254 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  36.95 
 
 
254 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  36.7 
 
 
251 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  36.7 
 
 
251 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  34.46 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  34.11 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
249 aa  146  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  60.34 
 
 
131 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  60.34 
 
 
131 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  52.5 
 
 
188 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  35.25 
 
 
266 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.79 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.59 
 
 
254 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.59 
 
 
254 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.59 
 
 
254 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.59 
 
 
254 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.59 
 
 
254 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.59 
 
 
254 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  33.79 
 
 
245 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  62.93 
 
 
127 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  62.93 
 
 
127 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  31.96 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  47.17 
 
 
158 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  31.16 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  31.16 
 
 
255 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  32.99 
 
 
260 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  32.99 
 
 
260 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  32.99 
 
 
260 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  30.14 
 
 
255 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  30.14 
 
 
255 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  30.14 
 
 
255 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  32.08 
 
 
260 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  32.17 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  29.9 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  30.2 
 
 
250 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  30.2 
 
 
250 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.93 
 
 
252 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  30.87 
 
 
249 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3276  transposase  62.93 
 
 
130 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  58.54 
 
 
127 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  36.56 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  50.76 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  47.09 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  47.09 
 
 
171 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  47.09 
 
 
171 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  48.44 
 
 
135 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  55.83 
 
 
145 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  42.35 
 
 
156 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  45.8 
 
 
131 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.79 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  50.38 
 
 
145 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.79 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06880  hypothetical protein  61.05 
 
 
94 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06950  hypothetical protein  61.05 
 
 
94 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  27.46 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  27.46 
 
 
249 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  50 
 
 
125 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  35.4 
 
 
252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>