More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  940    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 		 479 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  38.95 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  38.74 
 
 		 479 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  36.46 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  38.44 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.78 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.31 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.56 
 
 		 462 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  37.04 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.83 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  36.99 
 
 		 462 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 		 469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  38.53 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  35.64 
 
 		 474 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  40.6 
 
 		 465 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  37.77 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 		 465 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  38.33 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.05 
 
 		 473 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.09 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  36.9 
 
 		 470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  37.74 
 
 		 477 aa  252  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  36.52 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  36.96 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  34.72 
 
 		 499 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  34.37 
 
 		 602 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  33.92 
 
 		 473 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  35.9 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  36.26 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  35.85 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.9 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  34.13 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  37 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  39.09 
 
 		 466 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  36.91 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.38 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  36.38 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  35.65 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  35.95 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  35.63 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  34.9 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.6 
 
 		 705 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.58 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  33.98 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.6 
 
 		 448 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.76 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.65 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.77 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  36.78 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.32 
 
 		 596 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  36.05 
 
 		 447 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.15 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.44 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.09 
 
 		 764 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  29.68 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.2 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  32.3 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.2 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  28.38 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.27 
 
 		 448 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  34.7 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  32.84 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  30.53 
 
 		 473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.49 
 
 		 734 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 726 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 754 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.91 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.09 
 
 		 753 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.75 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.63 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  33.2 
 
 		 532 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.27 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  41.04 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  31.26 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.88 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  45.21 
 
 		 752 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  32.46 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  25.48 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 758 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.14 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.72 
 
 		 891 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  25.7 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  31 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 		 864 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>