88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  100 
 
 		 382 aa  775    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  65.26 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  64.27 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  63.49 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  55.18 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  38.24 
 
 		 656 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.89 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  34.96 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.19 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  40.43 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  36.7 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  36.7 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  36.07 
 
 		 363 aa  213  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  36.53 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  37.63 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  40.32 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  38.23 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  36.42 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.23 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  37.71 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.43 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  31.86 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.5 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.7 
 
 		 350 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  30.16 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.78 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.36 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  29.02 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.89 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.06 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.72 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  33.87 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.19 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.83 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  31.83 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.15 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.32 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.49 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  31.98 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  31.29 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.11 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  29.41 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.42 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.28 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.45 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.73 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.42 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.39 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  30.5 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  28.3 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.6 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.69 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.11 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.51 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.72 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.21 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.65 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.82 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  31.86 
 
 		 306 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.86 
 
 		 306 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.5 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.06 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  29.11 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  31.38 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.38 
 
 		 349 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  28.38 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  32.23 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  32.4 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.56 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  33.56 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  31.02 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.96 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.23 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.47 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.18 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  30.27 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  30.79 
 
 		 347 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  30.03 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  21.94 
 
 		 545 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  22.42 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1613  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.27 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3101  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.25 
 
 		 330 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5065  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.3 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.85 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.43 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1247  hypothetical protein  26.44 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3368  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.23 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0373  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.38 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>