More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  65.43 
 
 		 198 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  63.04 
 
 		 188 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  46.84 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  48.59 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  46.93 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  41.81 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  39.58 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  39.23 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  38.22 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 219 aa  95.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 195 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  39.25 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 198 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  38.07 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  34.87 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  36.22 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  38.59 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  36.93 
 
 		 223 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  39.57 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  36.31 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  38.42 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  37.71 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  37.99 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.17 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  34.32 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  35.6 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  27.62 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.66 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  24.18 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  29.95 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 528 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  27.98 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  27.39 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  27.39 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  27.39 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  26.75 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  26.34 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  23.26 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  30.36 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>