142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  100 
 
 		 383 aa  782    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  58.93 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  62.82 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  59.29 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  55.66 
 
 		 376 aa  362  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  46.74 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  43.42 
 
 		 389 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  48.77 
 
 		 477 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  45.89 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46.28 
 
 		 474 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  49.16 
 
 		 543 aa  275  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  43.79 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 628 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  41.02 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  39.73 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  41.16 
 
 		 347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  38.63 
 
 		 837 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  37.03 
 
 		 423 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  43.62 
 
 		 488 aa  256  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  44.37 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  44.48 
 
 		 678 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  43.17 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  41.33 
 
 		 503 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  39.75 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  39.8 
 
 		 778 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  43.88 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  41.86 
 
 		 495 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.49 
 
 		 490 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.16 
 
 		 487 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  40.73 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  40.79 
 
 		 829 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  38.81 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  38.54 
 
 		 815 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  38.49 
 
 		 497 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  38.44 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  35.17 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  38.54 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  34.38 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  38.75 
 
 		 309 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.64 
 
 		 820 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  37.87 
 
 		 1001 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  37.95 
 
 		 454 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  36.99 
 
 		 1037 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  36.3 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.56 
 
 		 697 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  34.19 
 
 		 1478 aa  173  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  38.08 
 
 		 370 aa  173  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  34.31 
 
 		 689 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  36.57 
 
 		 756 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.7 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  33.85 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  36.18 
 
 		 451 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  32.72 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  31.09 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  34.39 
 
 		 373 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  35.16 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  33.62 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  35.31 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  33.14 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  36.75 
 
 		 1019 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.25 
 
 		 1041 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  36.4 
 
 		 1059 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  36.4 
 
 		 1059 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  32.79 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  36.83 
 
 		 690 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  34.1 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  30.23 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.55 
 
 		 1018 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  37.01 
 
 		 388 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  32.28 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  35.42 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  31.49 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  31.86 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  32.48 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  36.19 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  31.13 
 
 		 619 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  34.02 
 
 		 1020 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  33.55 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  34.19 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  35.14 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  30.91 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  31.37 
 
 		 463 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  31.71 
 
 		 566 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 1146 aa  132  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  32.89 
 
 		 1050 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 619 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.51 
 
 		 770 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  30.97 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  29.9 
 
 		 674 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.4 
 
 		 912 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  33.53 
 
 		 1780 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  32.19 
 
 		 1331 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28.13 
 
 		 1495 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  27.85 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  26.74 
 
 		 806 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 639 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>