42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  100 
 
 		 360 aa  708    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  37.59 
 
 		 333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  28.36 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  30.17 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  25.37 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  24.42 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  27.64 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  24.4 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  23.34 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3661  hypothetical protein  26.55 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  22.94 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  26.09 
 
 		 371 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  24.91 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  24.24 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  24.4 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  26.26 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  26.45 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  23.37 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  22.35 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  25.38 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  23.39 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  27.87 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  23.77 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  23.01 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  27.69 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  22.74 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  27.84 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  22.74 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  31.58 
 
 		 435 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  31.58 
 
 		 435 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  31.58 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  31.58 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  31.58 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  31.58 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  30.19 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  21.55 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  21.55 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  22.47 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  23.12 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>