221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  100 
 
 
148 aa  307  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  56.85 
 
 
152 aa  176  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  56.06 
 
 
143 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  51.88 
 
 
147 aa  140  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  61.07 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  51.52 
 
 
153 aa  135  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  39.26 
 
 
177 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.69 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  38.28 
 
 
386 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38.57 
 
 
167 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.06 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  39.37 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  36.8 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  35.77 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  38.35 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.4 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  31.58 
 
 
512 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  32.52 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.88 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  40.43 
 
 
163 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
169 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  39.62 
 
 
490 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0361  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  31.78 
 
 
516 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  34.96 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0354  rfaE bifunctional protein  37.89 
 
 
486 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  30.6 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  50 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  34.29 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  50 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  34.93 
 
 
484 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  33.86 
 
 
495 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  35.42 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2196  cytidyltransferase-related  40.24 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  39.36 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  33.33 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0571  rfaE bifunctional protein  35.29 
 
 
486 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.861357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  43.75 
 
 
490 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  35.96 
 
 
488 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1603  bifunctional D-beta-D-heptose 7-phosphate kinase/D-beta-D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase  38.78 
 
 
490 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1615  bifunctional ADP-heptose synthase  37.76 
 
 
490 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  29.46 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  38.05 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0123  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  42.17 
 
 
496 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  31.5 
 
 
488 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.64 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5668  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  31.54 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4507  rfaE bifunctional protein  37.76 
 
 
490 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1432  bifunctional ADP-heptose synthase  37.5 
 
 
490 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  34.69 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  36.73 
 
 
490 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  33.67 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  34.78 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  31.58 
 
 
487 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33.86 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1750  cytidyltransferase-like protein  35.43 
 
 
502 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  31.25 
 
 
491 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.88 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  34.62 
 
 
451 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1071  cytidyltransferase-related, RfaE bifunctional protein  29.23 
 
 
488 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136639  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  33.81 
 
 
455 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  32.31 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33.85 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  40.74 
 
 
488 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.62 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  39.02 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
488 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  35.9 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  35.9 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  30.53 
 
 
487 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  37.18 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  37.18 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  35.9 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0574  cytidyltransferase-related domain protein  33.11 
 
 
516 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1884  bifunctional ADP-heptose synthase  28.47 
 
 
173 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3773  rfaE bifunctional protein  30.37 
 
 
482 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889229  normal  0.588929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.28 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0461  rfaE bifunctional protein  33.08 
 
 
464 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.640202  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  38.27 
 
 
485 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.5 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1299  bifunctional ADP-heptose synthase  28.46 
 
 
489 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  32.26 
 
 
464 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  32.63 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  39.24 
 
 
501 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1764  cytidyltransferase-like protein  31.29 
 
 
501 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  25 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  32.32 
 
 
185 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  35.42 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1031  rfaE bifunctional protein  34.69 
 
 
501 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.19 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1704  rfaE bifunctional protein  35.48 
 
 
479 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.08 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  33.66 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3401  cytidyltransferase-related domain protein  36.59 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.917267 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0796  putative ADP-heptose synthase  32 
 
 
526 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1062  cytidyltransferase-like protein  28.28 
 
 
508 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  30.53 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>