More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 179 aa  349  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  45.58 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  57.35 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  50 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 280 aa  51.6  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 428 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 223 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  35.48 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 415 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 225 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 244 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  35 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 419 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  35.59 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.56 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>